Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms