Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms