Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP68Q9UHB9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms