Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM5BQ9UGL1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms