Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLKQ9UBT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms