Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL42Q9P2K6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms