Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms