Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms