Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF38Q9NXL2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARHGEF38Q9NXL2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms