Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM6Q9NX76 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM6Q9NX76 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms