Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT4Q9NX09 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDIT4Q9NX09 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms