Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC52A1Q9NWF4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms