Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM28Q9NW13 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms