Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms