Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms