Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms