Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM5Q9C035 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms