Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXQ1Q9C009 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms