Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms