Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RTFDC1Q9BY42 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTFDC1Q9BY42 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms