Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms