Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM42Q9BTD8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms