Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AKAP9Q99996 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms