Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP9Q99956 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms