Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3R4Q99570 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms