Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIGSQ96S52 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIGSQ96S52 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms