Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms