Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT74Q96LB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms