Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPNS2Q96L46 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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