Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD4Q96KN9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms