Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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USP47Q96K76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP47Q96K76 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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