Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCHS1Q96JQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms