Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CELF6Q96J87 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms