Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms