Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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