Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms