Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms