Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD2Q969F2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms