Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms