Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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FAM3CQ92520 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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FAM3CQ92520 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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FAM3CQ92520 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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FAM3CQ92520 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3CQ92520 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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