Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms