Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms