Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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