Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf106Q8NAJ2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf106Q8NAJ2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms