Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF1Q8N6C5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms