Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms