Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HERC6Q8IVU3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms