Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms