Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH2Q76I76 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSH2Q76I76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms