Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM5Q71RC9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms